Un locus correspond à une place spécifique sur un chromosome, tandis qu'un allèle est une version donnée d'un gène. Le locus est invariable, car il s'agit d'un endroit physique sur le chromosome, caractérisé par des coordonnés; par exemple: 14 chromosome, bras long, etc.
L'allèle, comme mentionné, est une version d'un gène. Chaque gène possède 2 allèles (une version par chromosome). Les allèles du même gène varient entre les individus, ce qui explique la diversité qu'on retrouve dans une même espèce. En effet, une espèce a un nombre fixe de chromosomes, donc un nombre donné de loci (= pluriel de locus). En jouant avec ces deux notions, il faut toujours se rappeler que plusieurs allèles peuvent se trouver sur un locus, et non pas l'inverse.