"Le centre du typhon N.10 a touché terre près de la ville de Satsumasendai, dans le département de Kagoshima, vers 08h00 (23h00 GMT mercredi), a indiqué l'Agence météorologique japonaise (JMA).
Selon les opérateurs, 254'610 foyers étaient privés d'électricité en début de journée dans la région en raison du passage de Shanshan, accompagné de fortes pluies et de rafales de vent allant jusqu'à 252 km/h.
Face à cette situation, les autorités avaient déclenché mercredi leur plus haute "alerte spéciale" pour vents violents, fortes pluies et vagues de submersion.
Deux départements du sud de l'île de Kyushu devraient recevoir en 48h près de la moitié de la quantité annuelle reçue. A Kagoshima et Miyazaki, 500 mm de pluie en l'espace de 24h jusqu'à jeudi matin sont attendus, puis à nouveau 600 mm en 24h jusqu'à vendredi matin, selon la JMA.
Toyota suspend sa production
Le géant de l'automobile Toyota a annoncé mercredi suspendre sa production dans ses 14 usines au Japon entre mercredi après-midi et jusqu'à jeudi soir.
Par ailleurs, trois membres d'une même famille sont morts après qu'un glissement de terrain a enseveli une maison à Gamagori, une ville de la préfecture centrale d'Aichi, a rapporté tôt jeudi l'agence de presse Kyodo, citant des responsables du gouvernement local.
Parmi les personnes décédées figurent un couple de septuagénaires ainsi que leur fils d'une trentaine d'années, tandis que deux femmes d'une quarantaine d'années ont été blessées, a précisé l'agence de presse.
Trafic aérien perturbé
La compagnie aérienne Japan Airlines a annulé 172 vols intérieurs et 6 vols internationaux mercredi et jeudi. Sa concurrente ANA a annoncé avoir annulé 219 vols intérieurs et 4 internationaux entre mercredi et vendredi.
Les compagnies ferroviaires gérant les lignes à grande vitesse, les Shinkansen, ont d'ores et déjà annoncé que des trains pourraient également être annulés en fonction des conditions météorologiques cette semaine dans tout l'archipel.
Le typhon devrait parcourir le Japon d'ouest en est durant tout le reste de la semaine.
afp/fgn