L'ambassadeur afghan au Pakistan avait auparavant déclaré qu'un drone américain avait tué Hafiz Saeed Khan mais la coalition internationale stationnée à Kaboul avait refusé de confirmer l'information.
La frappe a eu lieu dans le district de Kot, dans la province afghane de Nangarhar, a précisé la source américaine.
Hafiz Saeed Khan est le deuxième responsable d'un groupe armée islamiste tué par l'armée américaine dans la région en quelques mois: en mai, un drone américain avait en effet tué le chef de file des taliban afghans, le mollah Akhtar Mansour, au Pakistan.
Donné pour mort l'an dernier
Le chef de l'EI pour l'Afghanistan et le Pakistan, ancien membre de la branche pakistanaise des taliban rallié à l'EI, avait déjà été donné pour mort l'an dernier mais son décès n'avait jamais été confirmé.
L'EI a revendiqué cette semaine un attentat suicide qui a fait au moins 74 morts dans un hôpital de Quetta, au Pakistan, également revendiqué par un groupe taliban pakistanais.
agences/hend