L'explosion a eu lieu peu avant 23h00 locales dans un marché animé où les gens mangeaient, près d'un hôtel prisé par les touristes et les hommes d'affaires. L'établissement n'a pas été touché.
"Nous avons retrouvé des éclats provenant d'un engin explosif improvisé", a déclaré un porte-parole de la présidence.
"Pour l'instant, nous ne pouvons pas encore apporter de réponse définitive à la question 'qui est derrière?'", a déclaré Paolo Duterte, maire adjoint de la ville.
Précédents attentats
Par le passé, Davao a été le théâtre d'attentats meurtriers commis par des militants islamistes ou des rebelles communistes. C'est également la ville d'origine du président Rodrigo Duterte, qui a engagé une brutale campagne de répression contre le trafic de drogue depuis son élection en mai dernier.
Le président philippin se trouvait d'ailleurs vendredi dans la ville dont il a été maire. Mais il était sain et sauf après l'explosion, a précisé son fils Paolo Duterte.
ats/boi/tmun
Séparatistes musulmans et rebelles communistes
Davao se situe sur l'île méridionale de Mindanao, où des séparatistes musulmans mènent depuis des décennies une rébellion armée qui a fait plus de 120'000 morts.
Les rebelles communistes, en lutte armée depuis 1968, sont aussi présents dans des zones rurales à proximité de Davao.