Comme lors du 1er tour, c'est la ministre socialiste Elisabeth Baume-Schneider qui termine largement en tête avec 14'397 voix (53,7%). Son colistier, l'actuel président du PS jurassien Michel Thentz arrive en 3e position avec 11'626 suffrages (43,4%) et fait donc son entrée au gouvernement.
Le ministre PDC Philippe Receveur termine à la 2e place avec 12'140 suffrages (45,3%). Sanctionné à l'issue du 1er tour, le ministre PDC des Finances et de la Police Charles Juillard est parvenu à limiter les dégâts et à décrocher une 4e place avec 11'524 suffrages (43,0)%.
Cinquième élu, le libéral-radical Michel Probst obtient 11'440 suffrages (42,7%). Il y a quatre ans, le ministre terminait à la 1ère place. Reste qu'avec la réélection de son ministre, le PLR évite un nouveau revers après la perte de trois sièges au Parlement. La participation s'est élevée à 49,9%.