Le séquençage de génome coûte moins cher
Séquencer son génome pour mieux connaître les forces et les faiblesses de son corps ne coûtera désormais plus que le prix d'une voiture, grâce à une nouvelle technique dévoilée lundi par une équipe de l'université américaine de Stanford.
Depuis que le génome humain a été séquencé en 2003 dans le cadre
d'un projet qui a coûté près de trois milliards de dollars (3,2
milliards de francs), son coût n'a cessé de diminuer.
En 2007, la société 454 Life Sciences avait annoncé le premier
séquençage d'un génome individuel en trois mois pour un coût d'un
million de dollars. En septembre de la même année, Craig Venter
devenait le premier homme à publier son génome en ligne.
L'an dernier, le prix du décodage de l'ADN humain était tombé à
250'000 dollars (270'000 francs) mais nécessitait encore le
concours de près de 200 personnes. Seuls une douzaine de génomes
humains ont été décodés dans leur quasi-intégralité à ce jour.
Du Boeing à la voiture haut de gamme
Stephen Quake, professeur de bio-ingénierie de l'Université de
Stanford, et deux de ses collaborateurs, Norma Neff et Dmitri
Pushkarev, annoncent maintenant avoir séquencé le génome de Quake
pour moins de 50'000 dollars (54'000 francs).
«Une tâche qui coûtait autant qu'un Boeing 747, ne coûte plus que
le prix moyen d'une voiture haut de gamme» et ne nécessite plus que
deux personnes, se félicite dans un communiqué le Centre médical de
Stanford.
«Pour la première fois, la démonstration a été faite qu'il n'est
pas nécessaire d'avoir un centre de génomique pour séquencer un
génome humain», déclarent les chercheurs.
Médecine individualisée
Dans leur étude publiée par la revue spécialisée Nature
Biotechnology, ils estiment que leur procédé «devrait permettre
d'importantes applications du séquençage du génome pour de nombreux
champs de la génétique et de la santé humaine».
Le génome ainsi obtenu est «complet à 95%», un niveau comparable à
celui obtenu par des méthodes plus coûteuses, annoncent les
chercheurs.
Le coût du séquençage du génome humain, qui permettra des
traitements plus individualisés et une médecine préventive plus
performante, devrait encore baisser à l'avenir. La société Pacific
Biosciences a prédit que d'ici 2013, elle serait capable de
séquencer un génome individuel en un quart d'heure et pour moins de
1000 dollars.
ats/ls
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Procédé complexe
Cette nouvelle technique repose sur le séquençage d'une seule molécule d'ADN, contre plusieurs milliers de copies par personne ou organisme vivant avec des méthodes plus anciennes.
Les quelque trois milliards de paires de bases de l'ADN de la molécule sont découpées en millions de rubans de 30 bases, puis placées sur un verre spécialement traité.
Les rubans sont alors «labellisés», chacun par l'une des lettres A,C,G,T qui composent l'ADN à l'aide d'un agent réactif fluorescent, avant d'être «lus» par une machine.
Le code génétique est ensuite recomposé à l'aide de puissants ordinateurs qui comparent chaque séquence au modèle de référence déjà établi par le Centre américain d'information pour les bio-technologies (NCBI).