Del Potro, vainqueur de l'US Open en 2009, menait 6-3, 3-2 quand Thiem, 10e mondial, a fait appel à l'encadrement médical du tournoi en raison d'un problème à un genou, avant d'abandonner.
L'Argentin, 142e mondial et bénéficiaire d'une invitation pour le tournoi new-yorkais, a fait son retour sur le circuit en mars dernier après deux années perturbées par des blessures aux poignets. Son dernier quart de finale en Grand Chelem remontait à Wimbledon en 2013.
Le récent médaillé d'argent aux Jeux olympiques de Rio est devenu le joueur le moins bien classé à atteindre les quarts de finale à Flushing Meadows depuis l'édition 1991 lorsque l'Américain Jimmy Connors, alors 174e mondial, s'était hissé à ce stade de la compétition.
"Ce n'est jamais très agréable de gagner un match par abandon de son adversaire, je souhaite à Dominic un prompt rétablissement, il a un grand avenir devant lui", a souligné Del Potro.
>> A lire aussi : US Open: Wawrinka se complique encore la vie
afp/adav